目的:阐释三七(Panax notoginseng, PN)对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA)菌株 ATCC43300(医院获得性)和 USA300(社区获得性)的药效差异及分子机制。方法:采用RNA-Seq技术分析PN干预对两株MRSA转录组的影响,以|log?FC|≥1.0且FDR<0.05为筛选标准,鉴定差异表达基因(DEGs)。进一步结合Gene Ontology(GO)和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)功能富集分析、加权基因共表达网络分析(WGCNA)及蛋白质互作网络(PPI)分析,识别相关的关键通路与核心调控基因。结果:在ATCC43300中,共鉴定出478个差异表达基因,其中上调基因201个,下调基因277个;在USA300中,鉴定出274个差异表达基因,其中上调基因130个,下调基因144个。ATCC43300中,支链氨基酸代谢和膜脂代谢通路显著上调;而在USA300中,嘌呤代谢和群体感应通路显著下调。WGCNA分析识别出与PN干预相关的核心模块,ATCC43300的核心模块富集在膜脂代谢相关基因,而USA300则富集在氨基酸代谢通路。PPI分析揭示,ATCC43300中与膜脂代谢和氧化还原相关的多个通路受到影响,而USA300中,嘌呤代谢与群体感应系统相关的多个基因通路受到抑制,表明PN可能通过干扰这些关键代谢和信号通路,削弱细菌的致病能力。
结论:PN可诱导MRSA菌株的多个代谢通路变化,表现出对不同菌株的代谢重构效应。ATCC43300中,支链氨基酸代谢与膜脂合成通路显著上调,可能通过增强代谢负担和氧化应激反应,干扰其膜结构稳定性与代谢稳态,从而削弱其生存适应性并影响耐药相关功能通路。USA300中,嘌呤代谢与群体感应系统显著下调,推测PN可通过抑制毒力因子表达削弱其致病能力。本研究揭示了PN对MRSA菌株的差异化转录调控机制,为其在不同MRSA菌株感染中的精准应用提供理论依据。